A pesar de su ubicación ecuatorial, el clima de Galápagos no es tan tropical como se podría imaginar. La topografía de la isla, las corrientes oceánicas y los vientos interactúan para modular las temperaturas y definir dos estaciones distintas.  

De enero a mayo, los vientos del sureste se debilitan, disminuyendo la influencia de las aguas frías provenientes de la Corriente "Humboldt" de Perú y del afloramiento ecuatorial. Esto se conoce como la estación cálida, caracterizada por elevadas temperaturas del mar y del aire, y lluvias convectivas. De junio a diciembre, los vientos se fortalecen y las temperaturas más frías dominan. 

Estas condiciones generan una capa persistente de nubes poco profundas y llovizna continua en la parte alta de la isla, y casi ninguna precipitación en el resto del archipiélago. Este efecto de sombra de lluvia crea dos amplias zonas climáticas terrestres: la zona alta húmeda  y la zona baja seca, con una zona de transición intermedia.

Dinámica de las precipitaciones en transición: La fuente de agua para el archipiélago de Galápagos bajo el cambio climático.

Esta red de 11 estaciones meteorológicas automáticas (EMA) establece un transecto Oeste Este (O-E) según la ubicación de las islas del archipiélago, su altitud, y su exposición sinóptica a las condiciones atmosféricas.

Se comparten observaciones de alta resolución temporal estándar como: precipitación, temperatura y humedad del aire, radiación solar; y dirección y velocidad del viento. En las estaciones costeras de Santa Cruz se calcula también turbulencia. La AWS del Cerro Crocker en la isla Santa Cruz cuenta con equipos especializados tipo radar y sensores ópticos que permiten comparar las variables de precipitación y entender mejor este fenómeno.